首先，通过两个案例分析scRNA-seq和snRNA-seq这两种技术的细微差异：

案例一

参考文献：Asingle-cellandsingle-nucleusRNA-Seqtoolboxforfreshandfrozenhumantumors，发表期刊：naturemedicine（IF58）。研究材料：人肿瘤组织。应用技术：scRNA-seq和snRNA-seq。该研究发现，在神经母细胞瘤中，scRNA-seq能够检测到更多的免疫细胞，如T细胞、B细胞和NK细胞等，而snRNA-seq则检测到更多的实质性细胞，如神经嵴和神经内分泌细胞等，免疫细胞的检出率明显降低。在乳腺癌转移样本中，scRNA-seq和snRNA-seq的结果也基本一致。两者在UMAP图中的重合度较高，各个集群都有检测结果，但比例有所偏差。

案例二

参考文献：Apan-grasstranscriptomerevealspatternsofcellulardivergenceincrops，发表期刊：Nature（IF505）。研究材料：泛草。应用技术：scRNA-seq和snRNA-seq。研究表明，这两种技术均能良好反映完整组织的表达模式，且相关性系数r≥0.7。此外，两者特异基因的表达模式也基本一致。然而，scRNA-seq检测的转录本和基因数量明显高于snRNA-seq，后者在分析中未经过组织解离，其GO结果显示的应激反应较低。在玉米的snRNA-seq细胞图谱中，还发现了新的细胞亚群。作者总结称，scRNA-seq和snRNA-seq的结合分析可产生更大的技术优势。

技术优势互补的案例分析

案例三

参考文献：Cellsoftheadulthumanheart，发表期刊：Nature（IF505）。研究材料：人心脏。应用技术：scRNA-seq和snRNA-seq。该研究联合使用这两种技术获得了完整的人心脏细胞图谱，强调了心肌细胞、周细胞和成纤维细胞的细胞异质性，揭示了不同发育起源和特性的心房及心室细胞亚群，从而提升了对人类心脏的研究认知，并为后续研究提供了有价值的参考。

案例四

参考文献：Single-cellmulti-omicandspatialprofilingofhumankidneysimplicatesthefibroticmicroenvironmentinkidneydiseaseprogression，发表期刊：Nature Genetics（IF317）。研究材料：人肾脏。应用技术：scRNA-seq、snRNA-seq、scATAC-seq联合10xVisium、CosMx。这篇研究通过多种技术平台，分析了81个肾脏样本近338600个单细胞/细胞核，旨在揭示健康与疾病状态下肾脏细胞类型与组织结构的复杂性，并探讨纤维化微环境在肾病预后中的作用。

scRNA-seq和snRNA-seq通过不同的方法分别获取不同细胞的基因表达信息，已发展成为成熟的技术手段。尽管scRNA-seq在免疫细胞和小胶质细胞的检测中更具优势，但在检测一些脆弱的基质细胞（如肝实质细胞、肾足细胞）以及临床样本时（如需确认病理情况的样本）和冻存组织样本中，snRNA-seq技术则表现出明显的优势。因此，利用这两者的互补优势，在同一研究中结合应用两种技术是非常可行的。

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